Evaluation of the Anyplex™ II HPV28 Real-Time PCR test from Seegene at Unilabs Lausanne

May 28, 2015

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Interview mit Herrn Dr. Pierre-Alain Menoud, Abteilung für Genetik bei UNILABS, Lausanne

 

Dr. Menoud, Sie haben sich entschieden, in Ihrem Labor für HPV Analysen den Linear Array® Test von Roche durch den Seegene Anyplex™ II HPV28 Test zu ersetzen, bei dem es sich um einen High Multiplex Real-Time-PCR Test handelt, der in einem Schritt Screening, Genotypisierung und Semiquantifizierung von 28 verschiedenen HPVs ermöglicht.
Was sind Ihrer Meinung nach die Vorteile des Anyplex™ II HPV28 Tests?

Die Vorteile des Anyplex™ II HPV28 Tests liegen zunächst einmal in der verwendeten Methode Real-Time-PCR: Das Kontaminationsrisiko ist geringer und die Analyse ist schneller als eine inverse Hybridisierung. Unsere Ergebnisse haben ausserdem gezeigt, dass der Anyplex™ II HPV28 Test weniger Probleme mit PCR-Inhibition bei hohen DNA-Konzentrationen hat. Zusätzlich ist die Auswertung der Ergebnisse automatisiert, was den Ablauf sicherer macht und die Validierung der Technik erleichtert.

Was ist Ihre Schlussfolgerung nach Abschluss der Studie, in der Sie Anyplex™ II HPV28 und Linear Array verglichen haben?

Die beiden Methoden zeigen bei Einfachinfektionen sehr ähnliche Werte in Bezug auf Sensibilität und Spezifität des Tests. Natürlich gibt es Unterschiede zwischen den Tests, einige Genotypen werden nur von einem der beiden Tests detektiert. Die Hochrisiko HPV-Typen werden von beiden Methoden detektiert. Bei den Mehrfachinfektionen zeigen die Ergebnisse, dass der Anyplex™ II HPV28 eine höhere Sensibilität hat.

Entspricht der Anyplex™ II HPV28 Test Ihren Erwartungen und den Erwartungen von Ihren Kunden?

Der Anyplex™ II HPV28 Test entspricht voll und ganz unseren Erwartungen, da er sich gut in unsere Laborroutine integrieren lässt und einfach in der Anwendung ist. Unsere Kunden wollen in erster Linie verlässliche Ergebnisse und vertrauen dabei unserer Entscheidung, was die Methode betrifft.

Der Anyplex™ II HPV28 Test kann simultan 19 Hochrisiko-HPV-Typen und 9 Niedrigrisiko-HPV-Typen detektieren, genotypisieren und quantifizieren. Sind im Test alle aktuell wichtigen HPV-Typen abgedeckt?

Ja, alle Hochrisiko-HPV-Typen werden mit hoher Sensibilität und Spezifität abgedeckt und das sowohl bei Einfach- als auch bei Mehrfachinfektionen.

Der Anyplex™ II HPV28 Test gehört zu einer Reihe von Tests, die auf Multiplex Real-Time-PCR beruhen und die sogenannte TOCE™ Technologie nutzen. Sie nutzen heute schon den Anyplex™ II HPV28 Test – haben Sie noch andere Tests von Seegene, die Sie in der Routine einsetzen?

Obwohl die Multiplex-Analysen bei unseren Kunden noch nicht sehr bekannt sind, werden sie in bestimmten klinischen Anwendungen immer beliebter. Wir haben uns daher entschieden, noch weitere Tests, die auf der TOCE™ Technologie beruhen, bei uns einzuführen: das Panel für respiratorische Viren (Anyplex™ II RV16), welches eine gleichzeitige Detektion von 16 Viren ermöglicht, sowie das Panel für respiratorische Bakterien, welche die fünf bekanntesten Erreger der Atemwege umfasst (Anyplex™ II RB5).

Wie zufrieden sind Sie mit dem Service von BÜHLMANN?

Bühlmann bietet einen hervorragenden Service insbesondere in Bezug auf die Schnelligkeit der Antworten wenn wir Probleme oder Fragen haben. Wir schätzendie Offenheit der Personen, die mit uns in Kontakt sind sehr. Ebenso ihre Transparenz in Bezug auf Seegene, wenn wir technische oder wissenschaftliche Auskünfte benötigen.

Vielen Dank für das Gespräch.

Ich arbeite seit mehreren Jahren mit der Bühlmann Laboratories AG zusammen und ich denke, es liegt Ihnen sehr am Herzen, innovative Lösungen zu erarbeiten, die nützlich für ein Diagnostik-Labor sind. Dafür danke ich Ihnen sehr herzlich.

 

Entretien avec le Dr. Pierre-Alain Menoud, département de génétique chez UNILABS, Lausanne


Dr Menoud, vous avez récemment décidé de changer votre technique Linear Array® de Roche pour mettre en place dans votre laboratoire le nouveau test Anyplex™ II HPV28 de Seegene, un test de PCR multiplexée en temps réel permettant simultanément la détection, le génotypage et la semi-quantification de 28 HPV. Selon vous, quels sont les avantages du test Anyplex™ II HPV28 de Seegene ?

Les premiers avantages du test Anyplex™ II HPV28 par rapport à la technique LinearArray sont intrinsèques au principe de PCR en temps réel : le risque de contamination est diminué et l’analyse est plus rapide par rapport à l’hybridation inverse. Nos résultats ont aussi démontré que le test Anyplex II HPV28 est moins sujet aux inhibitions liées à la concentration d’ADN extrait. Et enfin, l’analyse des données est automatisée ce qui sécurise le rendu de résultats et aide à la validation technique.

Quelles ont été les conclusions suite à l’évaluation comparative des deux tests Anyplex™ II HPV28 et Linear Array® ?

Les deux méthodes montrent des sensibilités et des spécificités comparables en cas d’infection simple. Bien entendu, les panels ne sont pas exactement identiques : certains génotypes sont parfois détectés par une méthode et pas par l’autre. Cependant, les génotypes à haut risque sont tous détectés quelle que soit la méthode. En cas d’infections multiples, les résultats ont montré que le test Anyplex II HPV28 est plus sensible.

Le test Anyplex™ II HPV28 répond-il à vos attentes ainsi qu’à celles de vos clients ?

Le test Anyplex™ II HPV28 répond tout à fait à nos attentes dans le sens où il s’intègre dans le flux des analyses de notre laboratoire et dans la simplicité de son utilisation. Quant aux clients, ils veulent un résultat fiable et nous font confiance dans le choix de la méthode.

Le test Anyplex™ II HPV28 peut simultanément détecter, génotyper et quantifier 19 HPV haut risques et 9 HPV bas risques. Est-ce que tous les variants HPV importants sont couverts aujourd’hui ?

Oui, tous les variants à haut risque connus sont détectés avec sensibilité et spécificité, qu’il s’agisse d’infections simples ou multiples.

Le test Anyplex™ II HPV28 appartient à la gamme de tests de PCR multiplexée en temps réel intégrant la technologie TOCE™. Vous utilisez le test Anyplex™ II HPV 28 en routine, avez-vous instauré d’autres tests de Seegene en routine ? Pour quelles raisons ?

Les analyses multiplexes, bien que pas encore bien connues chez nos clients, sont de plus en plus appréciées pour certaines indications cliniques. Nous avons donc choisi de mettre en place d’autres tests basés sur la technologie TOCE™: le panel respiratoire viral avec le test Anyplex™ II RV16 qui permet la détection de 16 virus respiratoires simultanément et le panel des infections respiratoires bactériennes qui couvrent les cinq bactéries respiratoires les plus courantes avec le test Anyplex™ II RB5.

Dans quelle mesure êtes-vous satisfait du service de BÜHLMANN ?

L’entreprise Bühlmann offre un service irréprochable notamment dans la rapidité de réponse lorsque nous avons des problèmes ou des questions. Nous apprécions beaucoup l’ouverture d’esprit des personnes qui sont en contact avec nous et leur transparence par rapport à Seegene quand nous avons besoin de renseignements techniques et scientifiques.

Nous vous remercions de nous avoir accordé cet entretien.

C’est avec plaisir que je travaille avec l’entreprise Bühlmann depuis plusieurs années. Vous avez toujours à cœur de nous apporter des services et des solutions innovantes très utiles pour le laboratoire de diagnostic. Merci à vous.

Evaluation of the Anyplex™ II HPV28 Real-Time PCR test from Seegene at Unilabs Lausanne

May 28, 2015

Deutsch | Français

Interview mit Herrn Dr. Pierre-Alain Menoud, Abteilung für Genetik bei UNILABS, Lausanne

 

Dr. Menoud, Sie haben sich entschieden, in Ihrem Labor für HPV Analysen den Linear Array® Test von Roche durch den Seegene Anyplex™ II HPV28 Test zu ersetzen, bei dem es sich um einen High Multiplex Real-Time-PCR Test handelt, der in einem Schritt Screening, Genotypisierung und Semiquantifizierung von 28 verschiedenen HPVs ermöglicht.
Was sind Ihrer Meinung nach die Vorteile des Anyplex™ II HPV28 Tests?

Die Vorteile des Anyplex™ II HPV28 Tests liegen zunächst einmal in der verwendeten Methode Real-Time-PCR: Das Kontaminationsrisiko ist geringer und die Analyse ist schneller als eine inverse Hybridisierung. Unsere Ergebnisse haben ausserdem gezeigt, dass der Anyplex™ II HPV28 Test weniger Probleme mit PCR-Inhibition bei hohen DNA-Konzentrationen hat. Zusätzlich ist die Auswertung der Ergebnisse automatisiert, was den Ablauf sicherer macht und die Validierung der Technik erleichtert.

Was ist Ihre Schlussfolgerung nach Abschluss der Studie, in der Sie Anyplex™ II HPV28 und Linear Array verglichen haben?

Die beiden Methoden zeigen bei Einfachinfektionen sehr ähnliche Werte in Bezug auf Sensibilität und Spezifität des Tests. Natürlich gibt es Unterschiede zwischen den Tests, einige Genotypen werden nur von einem der beiden Tests detektiert. Die Hochrisiko HPV-Typen werden von beiden Methoden detektiert. Bei den Mehrfachinfektionen zeigen die Ergebnisse, dass der Anyplex™ II HPV28 eine höhere Sensibilität hat.

Entspricht der Anyplex™ II HPV28 Test Ihren Erwartungen und den Erwartungen von Ihren Kunden?

Der Anyplex™ II HPV28 Test entspricht voll und ganz unseren Erwartungen, da er sich gut in unsere Laborroutine integrieren lässt und einfach in der Anwendung ist. Unsere Kunden wollen in erster Linie verlässliche Ergebnisse und vertrauen dabei unserer Entscheidung, was die Methode betrifft.

Der Anyplex™ II HPV28 Test kann simultan 19 Hochrisiko-HPV-Typen und 9 Niedrigrisiko-HPV-Typen detektieren, genotypisieren und quantifizieren. Sind im Test alle aktuell wichtigen HPV-Typen abgedeckt?

Ja, alle Hochrisiko-HPV-Typen werden mit hoher Sensibilität und Spezifität abgedeckt und das sowohl bei Einfach- als auch bei Mehrfachinfektionen.

Der Anyplex™ II HPV28 Test gehört zu einer Reihe von Tests, die auf Multiplex Real-Time-PCR beruhen und die sogenannte TOCE™ Technologie nutzen. Sie nutzen heute schon den Anyplex™ II HPV28 Test – haben Sie noch andere Tests von Seegene, die Sie in der Routine einsetzen?

Obwohl die Multiplex-Analysen bei unseren Kunden noch nicht sehr bekannt sind, werden sie in bestimmten klinischen Anwendungen immer beliebter. Wir haben uns daher entschieden, noch weitere Tests, die auf der TOCE™ Technologie beruhen, bei uns einzuführen: das Panel für respiratorische Viren (Anyplex™ II RV16), welches eine gleichzeitige Detektion von 16 Viren ermöglicht, sowie das Panel für respiratorische Bakterien, welche die fünf bekanntesten Erreger der Atemwege umfasst (Anyplex™ II RB5).

Wie zufrieden sind Sie mit dem Service von BÜHLMANN?

Bühlmann bietet einen hervorragenden Service insbesondere in Bezug auf die Schnelligkeit der Antworten wenn wir Probleme oder Fragen haben. Wir schätzendie Offenheit der Personen, die mit uns in Kontakt sind sehr. Ebenso ihre Transparenz in Bezug auf Seegene, wenn wir technische oder wissenschaftliche Auskünfte benötigen.

Vielen Dank für das Gespräch.

Ich arbeite seit mehreren Jahren mit der Bühlmann Laboratories AG zusammen und ich denke, es liegt Ihnen sehr am Herzen, innovative Lösungen zu erarbeiten, die nützlich für ein Diagnostik-Labor sind. Dafür danke ich Ihnen sehr herzlich.

 

Entretien avec le Dr. Pierre-Alain Menoud, département de génétique chez UNILABS, Lausanne


Dr Menoud, vous avez récemment décidé de changer votre technique Linear Array® de Roche pour mettre en place dans votre laboratoire le nouveau test Anyplex™ II HPV28 de Seegene, un test de PCR multiplexée en temps réel permettant simultanément la détection, le génotypage et la semi-quantification de 28 HPV. Selon vous, quels sont les avantages du test Anyplex™ II HPV28 de Seegene ?

Les premiers avantages du test Anyplex™ II HPV28 par rapport à la technique LinearArray sont intrinsèques au principe de PCR en temps réel : le risque de contamination est diminué et l’analyse est plus rapide par rapport à l’hybridation inverse. Nos résultats ont aussi démontré que le test Anyplex II HPV28 est moins sujet aux inhibitions liées à la concentration d’ADN extrait. Et enfin, l’analyse des données est automatisée ce qui sécurise le rendu de résultats et aide à la validation technique.

Quelles ont été les conclusions suite à l’évaluation comparative des deux tests Anyplex™ II HPV28 et Linear Array® ?

Les deux méthodes montrent des sensibilités et des spécificités comparables en cas d’infection simple. Bien entendu, les panels ne sont pas exactement identiques : certains génotypes sont parfois détectés par une méthode et pas par l’autre. Cependant, les génotypes à haut risque sont tous détectés quelle que soit la méthode. En cas d’infections multiples, les résultats ont montré que le test Anyplex II HPV28 est plus sensible.

Le test Anyplex™ II HPV28 répond-il à vos attentes ainsi qu’à celles de vos clients ?

Le test Anyplex™ II HPV28 répond tout à fait à nos attentes dans le sens où il s’intègre dans le flux des analyses de notre laboratoire et dans la simplicité de son utilisation. Quant aux clients, ils veulent un résultat fiable et nous font confiance dans le choix de la méthode.

Le test Anyplex™ II HPV28 peut simultanément détecter, génotyper et quantifier 19 HPV haut risques et 9 HPV bas risques. Est-ce que tous les variants HPV importants sont couverts aujourd’hui ?

Oui, tous les variants à haut risque connus sont détectés avec sensibilité et spécificité, qu’il s’agisse d’infections simples ou multiples.

Le test Anyplex™ II HPV28 appartient à la gamme de tests de PCR multiplexée en temps réel intégrant la technologie TOCE™. Vous utilisez le test Anyplex™ II HPV 28 en routine, avez-vous instauré d’autres tests de Seegene en routine ? Pour quelles raisons ?

Les analyses multiplexes, bien que pas encore bien connues chez nos clients, sont de plus en plus appréciées pour certaines indications cliniques. Nous avons donc choisi de mettre en place d’autres tests basés sur la technologie TOCE™: le panel respiratoire viral avec le test Anyplex™ II RV16 qui permet la détection de 16 virus respiratoires simultanément et le panel des infections respiratoires bactériennes qui couvrent les cinq bactéries respiratoires les plus courantes avec le test Anyplex™ II RB5.

Dans quelle mesure êtes-vous satisfait du service de BÜHLMANN ?

L’entreprise Bühlmann offre un service irréprochable notamment dans la rapidité de réponse lorsque nous avons des problèmes ou des questions. Nous apprécions beaucoup l’ouverture d’esprit des personnes qui sont en contact avec nous et leur transparence par rapport à Seegene quand nous avons besoin de renseignements techniques et scientifiques.

Nous vous remercions de nous avoir accordé cet entretien.

C’est avec plaisir que je travaille avec l’entreprise Bühlmann depuis plusieurs années. Vous avez toujours à cœur de nous apporter des services et des solutions innovantes très utiles pour le laboratoire de diagnostic. Merci à vous.